Участник:EvgSokolov/Песочница

Материал из MachineLearning.

< Участник:EvgSokolov(Различия между версиями)
Перейти к: навигация, поиск
Текущая версия (21:36, 10 сентября 2013) (править) (отменить)
(Полностью удалено содержимое страницы)
 
(20 промежуточных версий не показаны.)
Строка 1: Строка 1:
-
== fRMA (Frozen Robust Multi-Array Analysis) ==
 
-
Рассматривается следующая модель уровня экспрессии:
 
-
 
-
::<tex> Y_{ijkn} = \theta_{in} + \phi_{jn} + \gamma_{jkn} + \epsilon_{ijkn} </tex>
 
-
 
-
Здесь используются следующие обозначения:
 
-
 
-
::<tex>k</tex> — номер партии микрочипов <tex> k \in 1, \dots, K </tex>. Говорят, что два чипа принадлежат одной партии, если эксперименты с ними были проведены в одной лаборатории в одно и то же время.
 
-
::<tex>i</tex> — номер микрочипа <tex> i \in 1, \dots, I_k </tex>.
 
-
::<tex>n</tex> — номер набора проб <tex> n \in 1, \dots, N </tex>. Также через <tex>n</tex> мы будем обозначать номер гена, соответствующего <tex>n</tex>-му набору проб.
 
-
::<tex>j</tex> — номер пробы <tex> i \in 1, \dots, J_n </tex>.
 
-
::<tex>Y_{ijkn}</tex> — предобработанная (с вычтенным фоном и нормализованная) логарифмированная интенсивность пробы <tex>j</tex> из набора проб <tex>n</tex> микрочипа <tex>i</tex> из партии микрочипов <tex>k</tex>.
 
-
::<tex>\theta_{in}</tex> — экспрессия гена <tex>n</tex> на <tex>i</tex>-м микрочипе.
 
-
::<tex>\phi_{jn}</tex> — коэффициент сродства пробы <tex>j</tex> гену <tex>n</tex>.
 
-
::<tex>\gamma_{jkn}</tex> — величина, отвечающая за разницу интенсивностей между разными партиями проб.
 
-
::<tex>\epsilon_{ijkn}</tex> — случайная ошибка с нулевым средним.
 

Текущая версия

Личные инструменты